Cuando me levanto me encuentro la puerta del garaje automatica abierta y el mando no se ha tocado: que puede estar pasando.

Pues para asegurar que el problema no lo esta dando ningún mando deberías quitarle las pilas a todos los mandos y ver si sigue fallando o no. Lo siguiente sería ver si es alguna interferencia o algún vecino que por lo que sea se haya introducido su señal en la memoria de tu motor. Estas averías son un poco difíciles de atrapar.